Isabelle Faust musizierte als Preisträgerin des Leopold-Mozart-Wettbewerbs in Augsburg und des Paganini-Wettbewerbs in Genua bereits in jungen Jahren mit den Berliner Philharmonikern, dem Boston Symphony Orchestra, dem NHK Symphonieorchester Tokyo, dem Freiburger Barockorchester und dem Chamber Orchestra of Europe. Seit 2016 ist sie „Artistic Partner“ des Mahler Chamber Orchestra.
Isabelle Fausts Repertoire reicht vom Schaffen Bachs bis hin zu Werken zeitgenössischer Komponisten wie Ligeti. Besonders spezialisiert ist sie auf die historisch informierte Aufführungsweise der großen Violinkonzerte von Mozart (u. a. zyklisch bei der Mozartwoche Salzburg mit Il Giardino Armonico) bis Schumann (CD-Aufnahme mit dem Freiburger Barockorchester) und der klassischen Kammermusik (u.a. Gesamteinspielung der Beethoven-Sonaten gemeinsam mit dem Pianisten Alexander Melnikov). Sie hat Bachs Soloviolinwerke sowie seine Sonaten für Cembalo und Violine (mit Kristian Bezuidenhout als Partner am Tasteninstrument) aufgenommen und aufgeführt.
Regelmäßig arbeitet Isabelle Faust mit Dirigenten wie Sir John Eliot Gardiner, Philippe Herreweghe, Daniel Harding, Bernard Haitink, Mariss Jansons und Andris Nelsons zusammen. Groß ist die Anzahl der Preise für ihre CD-Aufnahmen (u. a. Diapason d’Or, Echo Klassik, Gramophone Award und der japanische Record Academy Award).
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